更新！Orbitrap Ascend Editions三合一質譜儀多項升級合集

Orbitrap Ascend Editions三合一質譜儀是一款革命性整合了多種碎裂和反應技術的創新平臺。它通過單一系統實現數據互補，極大簡化了工作流程，提升了分析效率與深度。該儀器顯著提升了在多組學研究中的覆蓋范圍，能夠加速生物制藥領域的藥物開發和質控分析，并為解析復雜蛋白質結構等前沿生命科學問題提供強大助力。

在更新的4.3版本軟件中，針對數據質量控制、智能數據采集、電子轉移裂解ETD、寡核苷酸分析等方向都進行了多項升級，可顯著提升多組學、生物制藥及結構生物學分析效能。

新增：實時數據質量控制 Real-Time Quality Control, RT-QC

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方法編輯器中新增了一個過濾功能，Real-Time QC，用戶可設定鑒定肽段數的上限或下限。數據采集過程中，進行實時檢索，若結果未滿足設定標準，Xcalibur序列將自動暫停，以便用戶檢查可能的原因，避免浪費剩下的樣品。

新增：自適應保留時間Adaptive RT

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自適應保留時間功能可根據采集的參考譜圖文件對被分析物的保留時間進行自動調節，可減少缺失值，且縮小靶標定量分析的保留時間窗口，有效提高分析通量。可用于PRM定量或者SQUAD及hybridDIA方法。

另外，AdaptiveRT的加入可更好地實現在一套系統中完成從發現到靶標分析的完整流程。

新增：HybridDIA

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HybridDIA 方法在同一針進樣中結合非靶標的DIA分析和基于靶標的tMS2分析，可同時進行發現型的DIA和靶標定量，適用于在非靶標分析的同時重點關注特定的靶標對象。

在Ascend儀器中，因為同時有orbitrap和離子阱質量分析器，可更好地實現并行分析，使用Orbitrap進行 DIA掃描并使用離子阱進行靶向的MS2掃描，在不損失DIA深度覆蓋性能的同時實現特定靶標的高靈敏度高通量定量。

更新：實時檢索RTS

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RTS SPS MS3方法在TMT實驗中可顯著提高定量準確性，新增的信噪比閾值過濾可進一步提高定量可信度。

當啟用實時檢索（RTS），在TMT SPS MS3模式下開啟Closeout功能時，界面將顯示新增的"MS3信噪比閾值"選項，可進行自定義。通過實時搜索鑒定的MS2譜圖若生成質量較差的MS3譜圖，將不再計入對應蛋白質的定量數值，更有助于提高定量準確性。

更新：實時譜庫檢索RTLS

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實時庫搜索（RTLS）可實現數據庫中相似化合物的智能采集。小分子分析模式下，新增的Modified Cosine Similarity在對比實驗譜圖與庫譜圖時，會同時考慮母離子之間的質量偏差，并據此對碎片離子的質荷比進行校正，從而更精確地計算相似性。

使用更新后的RTLS，無需人工干預，通過庫搜索可自動發現結構相關化合物。且由于匹配得分更高，能在未知樣品中發現更多可匹配的化合物。

更新：更快速的ETD 反應時間

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ETD碎裂在多種不同的研究領域都有重要應用，包括糖基化修飾、二硫鍵、從頭測序、top-down，middle-down分析等等。其中，ETD反應時間是一個非常重要的參數，影響碎裂效率、整體的循環時間等。

更新之后，離子阱中的ETD反應時間縮短，更接近離子注入時間，可實現更優的并行化效率。

新增：HDX 校正設置

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在氫氘交換質譜分析中，ETD方法能夠顯著提升分辨率，可從肽段水平精確至單個氨基酸殘基水平，這對于表位分析等需要精確定位結合位點的應用尤為重要。

其中，最小化 scrambling 至關重要。新增的 HDX 校正功能可一鍵設置后自動調節儀器參數，實現更溫和的離子傳輸，降低 HDX-ETD 實驗中的氫氘 scrambling，獲得更精準的相互作用位點定位。

新增：寡核苷酸模式

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目前的寡核苷酸分析中面臨多重挑戰：

● 譜圖復雜度高

● 存在大量同質異位碎片離子

● 產生難以解析的內部碎片

新增的寡核苷酸模式中，采用低 Mathieu q值CID技術，并對其進行校正，可有效降低二級譜圖的復雜程度，提高寡核苷酸分析的序列覆蓋度。用戶可通過調用寡核苷酸表征的方法模版進行操作，簡便易用。

本次Orbitrap Ascend Editions三合一質譜儀的多項升級，通過將更智能的實時采集控制、更快速的ETD反應，以及專為蛋白高級結構，寡核苷酸等復雜表征設計的解決方案融為一體，該平臺成功將多組學研究的覆蓋范圍、生物制藥開發的穩健性，以及結構生物學的解析精度推向新的高度。

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